Metascape 旨在开发一套可靠、高效且直观的工具,帮助生物医学研究界分析基因/蛋白质列表并做出更好的数据驱动决策。
尽管存在许多用于基因注释和基因列表富集分析的数据库和工具,但对于研究人员,尤其是那些没有接受过编程培训的研究人员来说,为其基因列表收集一些基本注释数据仍然具有挑战性。例如,将 RefSeq 编号列表转换为基因 ID/符号,或识别基因列表中的激酶或分泌蛋白可能是一项艰巨的任务,有时对于训练有素的生物信息学家来说甚至是一项不平凡的任务。
结果,所选候选基因的质量常常由于缺乏注释而受到影响。即使可以访问其中一些注释,研究人员经常需要花费大量时间在 Excel 中合并数据表,这是一个不简单且容易出错的过程。科研人员凭借多年进行这些分析和帮助他人的实践经验,自行组织开发了可以帮助更广泛的研究团体的免费资源。
简单点说,Metascape支持从各种格式基因上传,ID转换、注释(23年新增了基于chatGPT的注释)、到富集、蛋白互作以及各种可视化分析。输出结果方法包括但不局限于表格、circos图、富集条形图、富集热图、网络图、弦图、饼图等。
在线主页:
https://metascape.org/gp/index.html#/main/step1
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RNA-seq , 5