Waterfull 瀑布图 基因突变展示的利器

Waterfull 瀑布图 基因突变展示的利器

在研究基因组的文章,或者是生信的文章中,经常可以看到waterfull图,就是瀑布图,这种图分为2D和3D,在大多数文章中,一般展示的是2D图,一眼看上去,像是瀑布倾流而下,故得名瀑布图,这种图,开头,和结局是两根单独的柱子,中间是他们的变化情况,但是生信中常见的基因突变的瀑布图稍微有点不一样,下面就结合图来说一说如何看瀑布图

中间灰色的小格格那一部分,横轴是样本,纵轴是基因,有颜色的,说明该基因在该样本中发生了突变,根据后面条形图可以对应知道突变的频率,这里面颜色越接近黑色,突变频率越高,上面的柱状图反应的是该样本这些基因总的突变情况,下面的花花绿绿的柱状图,反映的是样本的具体的突变情况,是移码突变,还是错义突变等等。最后还要友情提示一下,虽然这个图看上去很复杂,但实际的制作,只需要用到一个叫做GenVisR的R包就可以完成。

发布于 2021-08-02 13:33
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