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做 WGCNA，但是你的组学数据又没有表型怎么办？那就创造一个表型呗！

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思路梳理

「step1:」 ssGSEA 进行免疫浸润分析，构建样品-免疫通路打分矩阵。参考：

• 单细胞专题15| 免疫浸润第2弹！5分钟掌握ssGSEA算法
  

「step2:」 通路差异分析鉴定关键的信号通路，以及相应的样品-免疫通路打分矩阵。参考：

• 单细胞专题15| 免疫浸润第2弹！5分钟掌握ssGSEA算法

「step3:」 WGCNA 构建表达谱共表达模块 vs 临床免疫表型（ssGSEA 打分矩阵）之间的相关性。最后就是 hub 基因（网络）的筛选，重要通路的描述等。参考：

• 做 WGCNA 网络分析你需要绘制哪些图？
  

图片来自这篇文章，详细的思路大家可以参考下：

• https://doi.org/10.3389/fneur.2022.807349

这个思路其实具有较强普适性，适用于任何表达谱（蛋白/代谢/转录/微生物/单细胞） vs 临床表型的关联分析。

怎么样？还在为你的 WGGCNA 和多组学关联而烦恼吗？赶紧动手试试上面的套路吧！

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OK，今天的分享到此为止，希望能对您有所帮助。

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