【慎用非线性MR】柳叶刀子刊维生素D相关NLMR文章撤稿,当前NLMR法恐存在漏洞

田田的叶 遗传社科研究 2023-12-04 10:41

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2023年12月1日,一篇曾于2021年发表在Lancet Diabetes & Endocrinology上关于维生素D与冠心病、中风和全因死亡率的研究论文被撤稿后重新发表(Retraction and Republication),主要原因是原版本论文所采用的非线性孟德尔随机化法(Nonlinear Mendelian Randomization,简称NLMR)存在估计方法上的问题,使得所得到的研究结论不可靠

原论文标题:Estimating dose-response relationships for vitamin D with coronary heart disease, stroke, and all-cause mortality: observational and Mendelian randomisation analyses

原论文doi:10.1016/S2213-8587(21)00263-1

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撤稿论文在出版社页面已明确标注

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撤稿论文尚未在PubMed标注



在2021年公开发表的原版本论文中,论文作者报道了在维生素D水平较低的人群中,25[OH]D浓度会降低全因死亡率。其中25羟维生素D(25-hydroxy vitamin D,简称25[OH]D)是维生素D在体内的主要存在形式,许多媒体和公众号也曾对该发现进行过报道。然而,在撤稿后重新发表的新版本论文中,25[OH]D浓度没有被发现会因果性降低全因死亡率、冠心病、中风风险。

图片2021原版本论文相关报道


对此,英国布里斯托大学(University of Bristol)统计遗传学家、MR方法论大佬George Davey Smith表示赞同。事实上,正是George Davey Smith在2023年初指出了原研究中NLMR方法和结果上存在的问题,原作者呈现的“维生素D低浓度组显著低风险和全浓度组不显著关联”,在方法和逻辑上是说不通的(not plausible):

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图片George Davey Smith关于原版本论文的质疑


George Davey Smith和合作者在2023年7月发表的论文中详细讨论了非线性孟德尔随机化法目前存在的问题,指出受估计方法和效率的限制,当前NLMR方法得到的研究结果很可能不可靠(Unreliable):

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【警示建议】从现有趋势来看,笔者建议所有正在使用或考虑使用NLMR法的研究人员暂停使用,进行论文写作时不要将NLMR纳入主研究分析中(顶多放附录),也不要将NLMR结果作为主要研究结论,因为很可能不可靠。NLMR相关的R包有nlmr、SUMnlmr等。

——【注意】这条警示建议只是针对非线性孟德尔随机化,经典的单样本/双样本线性孟德尔随机化结果仍然是可靠的。


参考文献:

[1] Estimating dose-response relationships for vitamin D with coronary heart disease, stroke, and all-cause mortality: observational and Mendelian randomisation analyses. Lancet Diabetes Endocrinol. 2023. doi:10.1016/S2213-8587(23)00287-5

[2] RETRACTED: Emerging Risk Factors Collaboration/EPIC-CVD/Vitamin D Studies Collaboration. Estimating dose-response relationships for vitamin D with coronary heart disease, stroke, and all-cause mortality: observational and Mendelian randomisation analyses. Lancet Diabetes Endocrinol. 2021;9(12):837-846. doi:10.1016/S2213-8587(21)00263-1

[3] Smith GD. Mendelian randomisation and vitamin D: the importance of model assumptions.Lancet Diabetes Endocrinol. 2023;11(1):14. doi:10.1016/S2213-8587(22)00345-X

[4] Wade KH, Hamilton FW, Carslake D, Sattar N, Davey Smith G, Timpson NJ. Challenges in undertaking nonlinear Mendelian randomization.Obesity (Silver Spring). 2023;31(12):2887-2890. doi:10.1002/oby.23927

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